La qualità dell'acqua non è una caratteristica della risorsa idrica per la quale esiste un sistema oggettivo di misura, bensì il metodo di valutazione della qualità della risorsa idrica è complesso e in continua evoluzione ed è stabilito dalla normativa europea e nazionale (d.lgs. n. 152/2006).

L'ARPA Valle d'Aosta gestisce una vasta rete di monitoraggio della qualità delle acque superficiali e sotterranee che dal 2010, con l'approvazione del Piano di gestione di distretto del fiume Po, ha subito una profonda revisione.

La qualità delle risorse idriche non si esaurisce però con la realizzazione di impianti di depurazione, i dati dell'ARPA e la comunità scientifica indicano conclusioni ben più complesse da gestire.

E' in corso infatti un'evoluzione significativa, sia delle disponibilità, sia della percezione che si ha delle risorse idriche, in relazione alle quali l'attenzione agli aspetti ambientali connessi ai corsi d'acqua e i nuovi usi ricreativi (dalla canoa al rafting, alla pesca o alla semplice fruizione naturalistica) richiedono ambienti il più possibili inalterati e di elevata qualità naturalistica.

La buona qualità delle acque si consegue attraverso un ampio ventaglio di azioni: la lotta all'inquinamento, la salvaguardia degli ecosistemi acquatici, una razionale ed efficiente organizzazione dei sistemi di distribuzione delle acque.

Il Piano regionale di tutela delle acque approvato nel 2006 aveva già indicato la necessità di integrare la gestione degli usi delle acque con quella dei corpi idrici dal punto di vista della salvaguardia o del recupero degli ecosistemi acquatici.

Il Piano di gestione del distretto idrografico del fiume Po, documento di programma richiesto dalla direttiva europea in materia di acque, ha confermato questa esigenza: la gestione degli aspetti quantitativi è strettamente connessa a quelli qualitativi, e una cattiva gestione dei prelievi o il deterioramento degli ecosistemi acquatici trova un'immediata ripercussione nei livelli di qualità delle risorse idriche.