Il museo conserva specie entomologiche appartenenti a diversi ordini e che comprendono alcune collezioni di coleotteri e di lepidotteri.
La collezione Hellman, Brockmann e Kristall, ad esempio, comprende esemplari di macrolepidotteri di cui la Valle d'Aosta è particolarmente ricca, presentando ben 1.141 specie tra cui alcuni endemismi, come Pharmacis anselminae (Teobaldelli, 1997), Pharmacis claudiae (Kristal & Hirneisen, 1994), Plebejus pylaon augustanus (Mentzer, 1956), Polyommatus humedasae (Toso & Balletto, 1976) e diverse specie osservate per la prima volta in Italia.
La collezione Manino include 143 specie di farfalle diurne che trovavano spazio nella vecchia esposizione del museo nella sala dedicata agli insetti.
La collezione Bocca-Debernardi consta di esemplari appartenenti all’ordine dei coleotteri, famiglie dei curculionidae, bruprestidae, cerambycidae e carabidae.